Les missions de B4B

>Développer et mettre à disposition les moyens nécessaires à l’accompagnement des projets de biologie mobilisant les technologies d’exploration des données « omics ».

>Accompagner les biologistes dans la mutation de leur métier en leur apportant des modules de formation, d’auto-formation et des environnements de travail adaptés.

>Participer à des projets de recherche pluridisciplinaires en partenariat avec des équipes de biologie ou de bioinformatique/biostatistique dans lesquels les compétences métiers du CATI en informatique, bioinformatique et biostatistique sont sollicitées.

>Fédérer un collectif de bioinformaticiens, biostatisticiens et informaticiens afin de construire et produire ensemble et monter en compétences d’ingénieries.

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Thématiques scientifiques
Bioinformatique
Biostatistique
Thématiques numériques
Traitement des données
Science des données et Big Data (Python, R)
Open data et Open science
Principes FAIR

Les communautés bénéficiaires

La communauté bénéficiaire du CATI B4B regroupe les biologistes ayant des besoins en analyse de données issues des technologies de séquençage à haut débit, dans des domaines tels que la génomique, la transcriptomique, l’épigénomique, la pangénomique ou la métagénomique, appliquées à des organismes microbiens, animaux ou végétaux et à l’étude des relations entre hôtes et microbiotes. La communauté bénéficiaire du CATI B4B inclut les utilisateurs des plateformes GenoToul Bioinfo, Get-PlaGe, Get-Trix et Sigenae, ainsi que les équipes de recherche collaborant avec les membres du CATI dans des projets pluridisciplinaires. 

Nos points forts

Un large panel de compétences

bioinformatiques

biostatistiques

développement informatique

intégration de données hétérogènes

management et gestion de projet

administration système

Nos objets d’études

microbes, animaux, végétaux

ADN, ARN, protéines

génomes, épigénomes, métagénomes, pangénomes

Nos forces

une infrastructure avec très grande capacité de calcul (Genotoul Bioinfo)

une plateforme de séquençage (Get-PlaGe)

haute compétence en assemblage de génomes depuis de nombreuses années

une expertise sur les données de séquençage longues lectures (métagénomique, génomique ou épigénétique)

offre logicielle et de pipeline multiples